1982年3月，国家物资总局党组批复了《北京物资学院关于“机构设置和人员编制”的请示报告》，原则上同意学校设立物资研究所。1986年9月，物资研究所正式成立。研究所下设物资经济研究室、物资管理研究室、物资技术研究室、情报资料室和《中国物资》编辑部。物资研究所的研究方向和任务是：物资经济理论研究，包括物资流通领域的专业理论研究、生产资料市场研究以及物资流通法规研究；管理科学与管理技术研究；物流技术与物流理论研究；承担学院下达的教学科研任务；《中国物资》编辑、出版和发行。1986年9月至1997年11月张绪昌任负责人，1997年11月至2001年4月程红任负责人。

      1994年6月，物资研究所更名为流通经济研究所，下设4个研究室、3个部和1个办公室，分别为流通经济研究室、流通管理研究室、流通技术与物流研究室、流通热点问题研究室；《中国流通经济》杂志编辑部、出版发行部、财务部；办公室。2001年3月学校机构调整，研究所解散，人员并入经济系。

      2009年10月，学校基于整合科研资源和进一步发挥学科优势和特色的考虑，重组成立流通经济研究所，赵娴任负责人。重组后的流通经济研究所是一个松散型的学术研究组织，隶属北京物资学院，由北京物资学院经济学院负责管理运作。

      目前，研究所的研究团队以经济学院经济系北京市优秀教学团队成员为主，并吸收了经济学院国际贸易教研室、金融学教研室以及其他院系相关专业的教师参加，同时还聘请了一批业内知名专家学者作为研究顾问和特约研究员。研究所的运行机制以项目管理的形式运行，相同研究方向的教师以项目为纽带集中在一起，发挥集体智慧和研究合力，致力于取得高水平的科研成果。